Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHD4Q14839 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHD4Q14839 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
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CHD4Q14839 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHD4Q14839 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
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