Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3AQ14563 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3AQ14563 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3AQ14563 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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