Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCARF1Q14162 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCARF1Q14162 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
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