Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIDRQ14159 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIDRQ14159 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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