Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IRF5Q13568 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRF5Q13568 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms