Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CBX3Q13185 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX3Q13185 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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