Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSM2AQ08AH3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSM2AQ08AH3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSM2AQ08AH3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms