Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
GBE1Q04446 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBE1Q04446 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms