Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EXOSC10Q01780 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EXOSC10Q01780 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms