Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF9Q00978 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms