Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA4Q00056 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA4Q00056 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA4Q00056 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms