Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUCB2P80303 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUCB2P80303 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUCB2P80303 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms