Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HBG1P69891 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HBG1P69891 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HBG1P69891 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HBG1P69891 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HBG1P69891 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HBG1P69891 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBG1P69891 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBG1P69891 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBG1P69891 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBG1P69891 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBG1P69891 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBG1P69891 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HBG1P69891 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBG1P69891 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBG1P69891 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBG1P69891 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBG1P69891 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBG1P69891 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBG1P69891 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBG1P69891 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBG1P69891 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBG1P69891 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBG1P69891 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBG1P69891 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBG1P69891 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HBG1P69891 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HBG1P69891 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBG1P69891 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBG1P69891 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBG1P69891 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBG1P69891 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBG1P69891 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBG1P69891 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HBG1P69891 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HBG1P69891 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HBG1P69891 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBG1P69891 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBG1P69891 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBG1P69891 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBG1P69891 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBG1P69891 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HBG1P69891 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBG1P69891 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBG1P69891 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBG1P69891 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBG1P69891 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBG1P69891 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HBG1P69891 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms