Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB2AP61019 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB2AP61019 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms