Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LOXL3P58215 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LOXL3P58215 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms