Protein–RNA interactions for Protein: P56703

WNT3, Proto-oncogene Wnt-3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3P56703 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3P56703 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3P56703 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3P56703 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3P56703 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3P56703 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WNT3P56703 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WNT3P56703 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WNT3P56703 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3P56703 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3P56703 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3P56703 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3P56703 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3P56703 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WNT3P56703 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WNT3P56703 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WNT3P56703 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WNT3P56703 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WNT3P56703 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WNT3P56703 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WNT3P56703 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WNT3P56703 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WNT3P56703 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WNT3P56703 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WNT3P56703 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WNT3P56703 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WNT3P56703 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WNT3P56703 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WNT3P56703 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WNT3P56703 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WNT3P56703 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WNT3P56703 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WNT3P56703 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WNT3P56703 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WNT3P56703 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WNT3P56703 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WNT3P56703 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WNT3P56703 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WNT3P56703 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WNT3P56703 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WNT3P56703 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WNT3P56703 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WNT3P56703 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WNT3P56703 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT3P56703 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT3P56703 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT3P56703 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT3P56703 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT3P56703 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT3P56703 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT3P56703 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT3P56703 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WNT3P56703 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms