Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME5P56597 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME5P56597 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME5P56597 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME5P56597 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NME5P56597 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NME5P56597 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME5P56597 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME5P56597 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME5P56597 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME5P56597 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME5P56597 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME5P56597 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME5P56597 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME5P56597 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME5P56597 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME5P56597 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME5P56597 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME5P56597 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME5P56597 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME5P56597 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME5P56597 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME5P56597 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME5P56597 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME5P56597 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME5P56597 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME5P56597 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME5P56597 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME5P56597 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME5P56597 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME5P56597 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME5P56597 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME5P56597 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME5P56597 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME5P56597 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME5P56597 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME5P56597 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME5P56597 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME5P56597 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME5P56597 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME5P56597 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME5P56597 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME5P56597 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME5P56597 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME5P56597 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME5P56597 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NME5P56597 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME5P56597 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME5P56597 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NME5P56597 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME5P56597 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME5P56597 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME5P56597 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME5P56597 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME5P56597 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME5P56597 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME5P56597 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME5P56597 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME5P56597 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME5P56597 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME5P56597 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME5P56597 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME5P56597 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME5P56597 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME5P56597 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME5P56597 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME5P56597 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME5P56597 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME5P56597 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME5P56597 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME5P56597 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME5P56597 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME5P56597 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME5P56597 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME5P56597 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME5P56597 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME5P56597 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME5P56597 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NME5P56597 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME5P56597 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME5P56597 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME5P56597 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME5P56597 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME5P56597 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME5P56597 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME5P56597 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME5P56597 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME5P56597 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME5P56597 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME5P56597 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms