Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3BP55884 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3BP55884 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3BP55884 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms