Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR1P51861 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR1P51861 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR1P51861 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR1P51861 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR1P51861 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR1P51861 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR1P51861 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR1P51861 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDR1P51861 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDR1P51861 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR1P51861 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR1P51861 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR1P51861 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR1P51861 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR1P51861 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDR1P51861 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR1P51861 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR1P51861 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR1P51861 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR1P51861 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR1P51861 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR1P51861 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDR1P51861 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR1P51861 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR1P51861 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR1P51861 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR1P51861 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDR1P51861 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR1P51861 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR1P51861 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR1P51861 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR1P51861 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR1P51861 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDR1P51861 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR1P51861 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR1P51861 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR1P51861 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR1P51861 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR1P51861 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR1P51861 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR1P51861 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR1P51861 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDR1P51861 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR1P51861 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR1P51861 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR1P51861 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR1P51861 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR1P51861 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR1P51861 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR1P51861 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR1P51861 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDR1P51861 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDR1P51861 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDR1P51861 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDR1P51861 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDR1P51861 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR1P51861 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR1P51861 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR1P51861 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR1P51861 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR1P51861 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR1P51861 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR1P51861 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDR1P51861 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR1P51861 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR1P51861 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR1P51861 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR1P51861 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR1P51861 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDR1P51861 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR1P51861 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR1P51861 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR1P51861 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR1P51861 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR1P51861 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR1P51861 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR1P51861 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDR1P51861 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDR1P51861 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms