Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8P50990 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8P50990 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8P50990 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8P50990 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8P50990 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8P50990 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8P50990 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8P50990 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8P50990 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8P50990 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8P50990 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8P50990 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8P50990 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8P50990 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8P50990 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8P50990 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8P50990 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8P50990 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8P50990 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8P50990 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8P50990 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8P50990 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8P50990 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8P50990 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT8P50990 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT8P50990 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT8P50990 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT8P50990 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT8P50990 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT8P50990 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT8P50990 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCT8P50990 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCT8P50990 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT8P50990 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT8P50990 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT8P50990 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCT8P50990 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCT8P50990 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCT8P50990 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCT8P50990 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCT8P50990 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8P50990 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8P50990 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8P50990 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8P50990 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8P50990 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8P50990 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8P50990 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8P50990 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCT8P50990 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8P50990 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8P50990 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8P50990 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8P50990 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8P50990 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCT8P50990 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCT8P50990 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8P50990 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8P50990 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8P50990 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8P50990 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8P50990 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8P50990 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCT8P50990 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms