Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCAMP50895 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCAMP50895 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCAMP50895 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCAMP50895 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCAMP50895 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAMP50895 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAMP50895 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAMP50895 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAMP50895 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAMP50895 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAMP50895 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAMP50895 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCAMP50895 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCAMP50895 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCAMP50895 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCAMP50895 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCAMP50895 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCAMP50895 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAMP50895 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCAMP50895 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BCAMP50895 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCAMP50895 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCAMP50895 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCAMP50895 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCAMP50895 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCAMP50895 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAMP50895 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCAMP50895 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCAMP50895 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCAMP50895 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BCAMP50895 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCAMP50895 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCAMP50895 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAMP50895 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAMP50895 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAMP50895 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAMP50895 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAMP50895 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAMP50895 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAMP50895 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAMP50895 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAMP50895 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAMP50895 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAMP50895 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAMP50895 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAMP50895 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAMP50895 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAMP50895 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BCAMP50895 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BCAMP50895 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCAMP50895 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCAMP50895 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCAMP50895 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCAMP50895 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BCAMP50895 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCAMP50895 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCAMP50895 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCAMP50895 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCAMP50895 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCAMP50895 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCAMP50895 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCAMP50895 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCAMP50895 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCAMP50895 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCAMP50895 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCAMP50895 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCAMP50895 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCAMP50895 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAMP50895 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAMP50895 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAMP50895 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAMP50895 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAMP50895 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAMP50895 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAMP50895 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCAMP50895 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCAMP50895 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCAMP50895 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCAMP50895 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms