Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK7P50613 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK7P50613 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK7P50613 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK7P50613 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK7P50613 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK7P50613 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK7P50613 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK7P50613 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDK7P50613 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK7P50613 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK7P50613 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK7P50613 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK7P50613 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK7P50613 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK7P50613 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK7P50613 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK7P50613 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK7P50613 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK7P50613 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK7P50613 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK7P50613 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK7P50613 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK7P50613 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK7P50613 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK7P50613 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK7P50613 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK7P50613 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK7P50613 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK7P50613 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK7P50613 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK7P50613 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK7P50613 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK7P50613 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK7P50613 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK7P50613 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK7P50613 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK7P50613 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK7P50613 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK7P50613 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK7P50613 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK7P50613 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK7P50613 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK7P50613 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK7P50613 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK7P50613 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK7P50613 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK7P50613 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK7P50613 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK7P50613 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK7P50613 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK7P50613 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK7P50613 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK7P50613 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK7P50613 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK7P50613 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK7P50613 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK7P50613 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK7P50613 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK7P50613 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK7P50613 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK7P50613 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK7P50613 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK7P50613 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK7P50613 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK7P50613 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK7P50613 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK7P50613 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK7P50613 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK7P50613 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK7P50613 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK7P50613 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK7P50613 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK7P50613 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK7P50613 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK7P50613 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK7P50613 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK7P50613 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK7P50613 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK7P50613 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK7P50613 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK7P50613 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK7P50613 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK7P50613 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK7P50613 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK7P50613 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK7P50613 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK7P50613 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK7P50613 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK7P50613 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms