Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSEN1P49768 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSEN1P49768 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms