Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRIM2P49643 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRIM2P49643 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRIM2P49643 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRIM2P49643 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRIM2P49643 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRIM2P49643 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRIM2P49643 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRIM2P49643 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRIM2P49643 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRIM2P49643 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms