Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMAN1P49257 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms