Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PITPNBP48739 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PITPNBP48739 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms