Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX3P48380 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX3P48380 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX3P48380 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX3P48380 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX3P48380 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX3P48380 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX3P48380 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX3P48380 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFX3P48380 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFX3P48380 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX3P48380 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX3P48380 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX3P48380 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX3P48380 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX3P48380 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX3P48380 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX3P48380 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX3P48380 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX3P48380 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX3P48380 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX3P48380 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX3P48380 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX3P48380 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX3P48380 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX3P48380 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RFX3P48380 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX3P48380 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX3P48380 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX3P48380 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX3P48380 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RFX3P48380 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX3P48380 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX3P48380 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX3P48380 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX3P48380 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX3P48380 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX3P48380 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX3P48380 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX3P48380 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX3P48380 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX3P48380 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX3P48380 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX3P48380 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms