Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC6A11P48066 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A11P48066 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A11P48066 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms