Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEDD4P46934 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEDD4P46934 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.58■■■□□ 2
NEDD4P46934 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NEDD4P46934 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD4P46934 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD4P46934 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD4P46934 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD4P46934 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD4P46934 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD4P46934 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEDD4P46934 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD4P46934 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD4P46934 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD4P46934 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD4P46934 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD4P46934 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD4P46934 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD4P46934 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD4P46934 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4P46934 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4P46934 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4P46934 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4P46934 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4P46934 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4P46934 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4P46934 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4P46934 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4P46934 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4P46934 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD4P46934 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD4P46934 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD4P46934 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD4P46934 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEDD4P46934 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEDD4P46934 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEDD4P46934 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD4P46934 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD4P46934 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEDD4P46934 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEDD4P46934 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEDD4P46934 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEDD4P46934 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms