Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFMP43652 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFMP43652 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFMP43652 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFMP43652 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFMP43652 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFMP43652 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFMP43652 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
AFMP43652 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
AFMP43652 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFMP43652 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFMP43652 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFMP43652 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFMP43652 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFMP43652 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFMP43652 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFMP43652 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFMP43652 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFMP43652 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFMP43652 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFMP43652 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFMP43652 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFMP43652 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFMP43652 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFMP43652 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFMP43652 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFMP43652 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AFMP43652 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFMP43652 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFMP43652 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFMP43652 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFMP43652 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFMP43652 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AFMP43652 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFMP43652 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFMP43652 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFMP43652 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFMP43652 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFMP43652 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFMP43652 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
AFMP43652 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFMP43652 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFMP43652 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFMP43652 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFMP43652 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFMP43652 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFMP43652 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFMP43652 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFMP43652 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFMP43652 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFMP43652 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFMP43652 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFMP43652 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AFMP43652 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFMP43652 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFMP43652 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFMP43652 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFMP43652 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFMP43652 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFMP43652 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFMP43652 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFMP43652 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFMP43652 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFMP43652 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFMP43652 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFMP43652 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFMP43652 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFMP43652 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFMP43652 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFMP43652 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFMP43652 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFMP43652 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFMP43652 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFMP43652 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFMP43652 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFMP43652 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFMP43652 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFMP43652 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AFMP43652 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFMP43652 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFMP43652 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFMP43652 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFMP43652 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AFMP43652 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFMP43652 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AFMP43652 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFMP43652 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFMP43652 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFMP43652 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
AFMP43652 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFMP43652 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFMP43652 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AFMP43652 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
AFMP43652 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFMP43652 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFMP43652 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFMP43652 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFMP43652 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AFMP43652 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AFMP43652 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms