Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR2P43308 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR2P43308 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSR2P43308 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSR2P43308 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSR2P43308 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR2P43308 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR2P43308 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR2P43308 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR2P43308 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSR2P43308 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR2P43308 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR2P43308 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR2P43308 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSR2P43308 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR2P43308 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR2P43308 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR2P43308 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR2P43308 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR2P43308 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR2P43308 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR2P43308 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSR2P43308 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR2P43308 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR2P43308 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR2P43308 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR2P43308 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR2P43308 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR2P43308 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR2P43308 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR2P43308 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR2P43308 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR2P43308 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR2P43308 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR2P43308 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR2P43308 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR2P43308 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR2P43308 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms