Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL5P42830 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL5P42830 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms