Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PIK3CAP42336 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PIK3CAP42336 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIK3CAP42336 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms