Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHAP40939 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHAP40939 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HADHAP40939 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHAP40939 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHAP40939 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHAP40939 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHAP40939 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHAP40939 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHAP40939 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHAP40939 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HADHAP40939 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HADHAP40939 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHAP40939 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHAP40939 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHAP40939 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHAP40939 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHAP40939 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHAP40939 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHAP40939 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HADHAP40939 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HADHAP40939 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHAP40939 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHAP40939 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHAP40939 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHAP40939 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHAP40939 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHAP40939 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHAP40939 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHAP40939 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHAP40939 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HADHAP40939 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HADHAP40939 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHAP40939 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHAP40939 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHAP40939 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHAP40939 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHAP40939 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHAP40939 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HADHAP40939 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHAP40939 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHAP40939 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHAP40939 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHAP40939 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHAP40939 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHAP40939 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHAP40939 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHAP40939 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHAP40939 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HADHAP40939 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHAP40939 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHAP40939 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHAP40939 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHAP40939 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHAP40939 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHAP40939 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HADHAP40939 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHAP40939 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHAP40939 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHAP40939 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHAP40939 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHAP40939 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HADHAP40939 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HADHAP40939 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHAP40939 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHAP40939 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHAP40939 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHAP40939 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHAP40939 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HADHAP40939 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHAP40939 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHAP40939 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHAP40939 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHAP40939 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHAP40939 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHAP40939 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHAP40939 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HADHAP40939 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms