Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARL4AP40617 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL4AP40617 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms