Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCAP37840 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCAP37840 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCAP37840 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCAP37840 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCAP37840 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCAP37840 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCAP37840 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCAP37840 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCAP37840 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCAP37840 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCAP37840 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCAP37840 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCAP37840 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNCAP37840 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNCAP37840 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCAP37840 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCAP37840 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCAP37840 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms