Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL4P36578 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL4P36578 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL4P36578 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL4P36578 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL4P36578 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL4P36578 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL4P36578 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL4P36578 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL4P36578 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL4P36578 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL4P36578 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL4P36578 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL4P36578 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL4P36578 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL4P36578 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL4P36578 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL4P36578 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL4P36578 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL4P36578 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL4P36578 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL4P36578 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL4P36578 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL4P36578 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL4P36578 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL4P36578 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL4P36578 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL4P36578 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL4P36578 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL4P36578 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL4P36578 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL4P36578 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL4P36578 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL4P36578 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL4P36578 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL4P36578 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL4P36578 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL4P36578 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL4P36578 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL4P36578 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL4P36578 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL4P36578 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL4P36578 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL4P36578 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL4P36578 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL4P36578 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL4P36578 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL4P36578 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL4P36578 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL4P36578 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL4P36578 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL4P36578 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL4P36578 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL4P36578 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL4P36578 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL4P36578 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL4P36578 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL4P36578 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL4P36578 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL4P36578 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL4P36578 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL4P36578 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL4P36578 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL4P36578 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL4P36578 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL4P36578 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL4P36578 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL4P36578 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL4P36578 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL4P36578 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms