Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA3P32297 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms