Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDI1P31150 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDI1P31150 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDI1P31150 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDI1P31150 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDI1P31150 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDI1P31150 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI1P31150 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI1P31150 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI1P31150 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI1P31150 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI1P31150 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI1P31150 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI1P31150 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI1P31150 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDI1P31150 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDI1P31150 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDI1P31150 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDI1P31150 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GDI1P31150 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GDI1P31150 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDI1P31150 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDI1P31150 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GDI1P31150 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDI1P31150 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDI1P31150 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDI1P31150 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDI1P31150 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GDI1P31150 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDI1P31150 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDI1P31150 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDI1P31150 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDI1P31150 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDI1P31150 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDI1P31150 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDI1P31150 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GDI1P31150 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDI1P31150 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDI1P31150 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDI1P31150 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDI1P31150 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDI1P31150 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDI1P31150 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDI1P31150 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDI1P31150 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDI1P31150 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDI1P31150 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDI1P31150 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDI1P31150 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDI1P31150 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDI1P31150 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDI1P31150 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDI1P31150 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDI1P31150 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDI1P31150 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDI1P31150 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDI1P31150 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GDI1P31150 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDI1P31150 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDI1P31150 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDI1P31150 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDI1P31150 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDI1P31150 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDI1P31150 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDI1P31150 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDI1P31150 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDI1P31150 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDI1P31150 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GDI1P31150 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDI1P31150 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDI1P31150 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI1P31150 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI1P31150 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI1P31150 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI1P31150 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI1P31150 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI1P31150 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI1P31150 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI1P31150 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI1P31150 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI1P31150 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI1P31150 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI1P31150 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI1P31150 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI1P31150 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI1P31150 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI1P31150 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI1P31150 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI1P31150 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI1P31150 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI1P31150 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI1P31150 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI1P31150 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI1P31150 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI1P31150 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI1P31150 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI1P31150 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI1P31150 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDI1P31150 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDI1P31150 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms