Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIPP30301 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIPP30301 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIPP30301 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MIPP30301 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIPP30301 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIPP30301 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIPP30301 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIPP30301 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIPP30301 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIPP30301 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIPP30301 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIPP30301 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIPP30301 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIPP30301 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MIPP30301 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MIPP30301 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIPP30301 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIPP30301 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MIPP30301 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIPP30301 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIPP30301 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIPP30301 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIPP30301 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MIPP30301 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIPP30301 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIPP30301 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIPP30301 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MIPP30301 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIPP30301 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIPP30301 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIPP30301 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIPP30301 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIPP30301 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIPP30301 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIPP30301 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIPP30301 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIPP30301 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIPP30301 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIPP30301 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIPP30301 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MIPP30301 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIPP30301 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIPP30301 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIPP30301 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIPP30301 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MIPP30301 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIPP30301 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIPP30301 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIPP30301 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIPP30301 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIPP30301 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIPP30301 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIPP30301 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIPP30301 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIPP30301 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MIPP30301 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MIPP30301 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIPP30301 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIPP30301 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIPP30301 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIPP30301 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPP30301 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPP30301 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPP30301 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPP30301 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPP30301 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPP30301 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPP30301 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIPP30301 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPP30301 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPP30301 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPP30301 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPP30301 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPP30301 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPP30301 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIPP30301 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms