Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHA2P29317 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA2P29317 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA2P29317 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA2P29317 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA2P29317 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA2P29317 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA2P29317 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA2P29317 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHA2P29317 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA2P29317 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EPHA2P29317 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA2P29317 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHA2P29317 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA2P29317 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA2P29317 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA2P29317 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA2P29317 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA2P29317 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA2P29317 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA2P29317 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA2P29317 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA2P29317 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHA2P29317 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA2P29317 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA2P29317 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA2P29317 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA2P29317 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHA2P29317 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EPHA2P29317 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA2P29317 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA2P29317 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA2P29317 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA2P29317 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA2P29317 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA2P29317 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA2P29317 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA2P29317 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHA2P29317 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA2P29317 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA2P29317 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA2P29317 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA2P29317 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA2P29317 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EPHA2P29317 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EPHA2P29317 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EPHA2P29317 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHA2P29317 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA2P29317 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms