Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LAMA1P25391 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMA1P25391 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms