Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDELR1P24390 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDELR1P24390 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms