Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRDP23468 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRDP23468 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRDP23468 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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