Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN1P21941 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN1P21941 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN1P21941 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN1P21941 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN1P21941 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN1P21941 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN1P21941 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN1P21941 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN1P21941 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MATN1P21941 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN1P21941 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN1P21941 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN1P21941 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN1P21941 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN1P21941 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN1P21941 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN1P21941 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MATN1P21941 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN1P21941 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN1P21941 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN1P21941 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN1P21941 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN1P21941 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MATN1P21941 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MATN1P21941 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MATN1P21941 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN1P21941 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN1P21941 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN1P21941 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN1P21941 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN1P21941 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN1P21941 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN1P21941 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN1P21941 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MATN1P21941 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN1P21941 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN1P21941 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN1P21941 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN1P21941 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN1P21941 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN1P21941 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MATN1P21941 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN1P21941 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MATN1P21941 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MATN1P21941 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MATN1P21941 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN1P21941 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN1P21941 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN1P21941 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN1P21941 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN1P21941 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN1P21941 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN1P21941 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN1P21941 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN1P21941 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MATN1P21941 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MATN1P21941 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MATN1P21941 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MATN1P21941 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MATN1P21941 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN1P21941 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN1P21941 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN1P21941 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN1P21941 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MATN1P21941 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms