Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BGNP21810 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BGNP21810 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BGNP21810 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BGNP21810 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BGNP21810 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BGNP21810 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BGNP21810 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BGNP21810 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BGNP21810 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BGNP21810 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BGNP21810 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BGNP21810 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BGNP21810 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BGNP21810 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BGNP21810 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BGNP21810 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BGNP21810 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BGNP21810 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BGNP21810 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BGNP21810 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BGNP21810 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BGNP21810 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BGNP21810 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BGNP21810 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BGNP21810 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BGNP21810 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BGNP21810 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BGNP21810 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BGNP21810 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BGNP21810 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BGNP21810 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BGNP21810 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BGNP21810 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BGNP21810 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BGNP21810 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BGNP21810 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BGNP21810 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BGNP21810 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BGNP21810 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BGNP21810 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BGNP21810 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BGNP21810 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BGNP21810 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BGNP21810 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BGNP21810 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BGNP21810 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BGNP21810 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BGNP21810 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BGNP21810 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BGNP21810 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BGNP21810 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BGNP21810 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BGNP21810 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BGNP21810 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BGNP21810 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BGNP21810 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BGNP21810 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BGNP21810 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BGNP21810 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BGNP21810 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BGNP21810 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BGNP21810 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BGNP21810 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BGNP21810 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BGNP21810 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BGNP21810 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms