Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP4AP20648 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP4AP20648 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP4AP20648 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP4AP20648 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms