Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
ERCC3P19447 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERCC3P19447 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC3P19447 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms