Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDCP19113 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDCP19113 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDCP19113 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDCP19113 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HDCP19113 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDCP19113 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDCP19113 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDCP19113 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDCP19113 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDCP19113 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDCP19113 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDCP19113 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDCP19113 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDCP19113 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDCP19113 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDCP19113 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDCP19113 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDCP19113 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDCP19113 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDCP19113 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDCP19113 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDCP19113 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDCP19113 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDCP19113 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDCP19113 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDCP19113 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDCP19113 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDCP19113 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HDCP19113 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDCP19113 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDCP19113 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDCP19113 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDCP19113 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDCP19113 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDCP19113 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDCP19113 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDCP19113 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDCP19113 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDCP19113 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDCP19113 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDCP19113 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDCP19113 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDCP19113 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDCP19113 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDCP19113 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDCP19113 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDCP19113 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDCP19113 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDCP19113 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDCP19113 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDCP19113 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDCP19113 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDCP19113 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDCP19113 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDCP19113 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDCP19113 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDCP19113 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDCP19113 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDCP19113 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDCP19113 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDCP19113 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDCP19113 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDCP19113 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDCP19113 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDCP19113 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDCP19113 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDCP19113 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDCP19113 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDCP19113 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDCP19113 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDCP19113 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDCP19113 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDCP19113 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDCP19113 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDCP19113 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDCP19113 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDCP19113 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDCP19113 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDCP19113 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDCP19113 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDCP19113 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDCP19113 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDCP19113 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDCP19113 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDCP19113 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDCP19113 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDCP19113 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDCP19113 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDCP19113 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDCP19113 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDCP19113 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDCP19113 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDCP19113 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDCP19113 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDCP19113 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDCP19113 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDCP19113 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDCP19113 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDCP19113 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms