Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYN1P17600 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYN1P17600 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYN1P17600 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYN1P17600 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYN1P17600 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYN1P17600 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYN1P17600 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYN1P17600 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYN1P17600 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYN1P17600 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYN1P17600 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYN1P17600 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYN1P17600 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYN1P17600 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYN1P17600 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYN1P17600 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYN1P17600 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYN1P17600 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYN1P17600 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYN1P17600 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYN1P17600 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYN1P17600 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYN1P17600 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYN1P17600 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYN1P17600 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYN1P17600 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYN1P17600 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYN1P17600 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYN1P17600 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYN1P17600 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYN1P17600 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYN1P17600 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYN1P17600 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYN1P17600 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYN1P17600 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYN1P17600 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYN1P17600 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYN1P17600 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYN1P17600 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYN1P17600 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYN1P17600 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYN1P17600 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYN1P17600 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYN1P17600 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYN1P17600 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYN1P17600 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYN1P17600 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYN1P17600 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYN1P17600 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYN1P17600 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYN1P17600 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYN1P17600 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYN1P17600 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYN1P17600 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYN1P17600 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYN1P17600 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYN1P17600 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYN1P17600 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYN1P17600 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYN1P17600 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYN1P17600 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYN1P17600 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYN1P17600 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYN1P17600 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYN1P17600 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYN1P17600 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYN1P17600 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYN1P17600 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYN1P17600 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYN1P17600 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYN1P17600 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYN1P17600 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYN1P17600 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYN1P17600 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYN1P17600 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYN1P17600 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYN1P17600 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYN1P17600 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms